Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NFX1Q12986 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFX1Q12986 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
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