Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LMAN2Q12907 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LMAN2Q12907 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LMAN2Q12907 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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