Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FOXO1Q12778 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FOXO1Q12778 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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