Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCAPQ12770 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCAPQ12770 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
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