Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 VBA1YMR088C 1689 nt5.12□□□□□ -1.59
USB1Q12208 VTH1YIL173W 4650 nt5.11□□□□□ -1.59
USB1Q12208 VTH2YJL222W 4650 nt5.11□□□□□ -1.59
USB1Q12208 BUD32YGR262C 786 nt5.11□□□□□ -1.59
USB1Q12208 SUP19tS(UGA)E 82 nt5.11□□□□□ -1.59
USB1Q12208 SUP17tS(UGA)I 82 nt5.11□□□□□ -1.59
USB1Q12208 SUP16tS(UGA)P 82 nt5.11□□□□□ -1.59
USB1Q12208 RPE1YJL121C 717 nt5.11□□□□□ -1.59
USB1Q12208 CIN4YMR138W 576 nt5.11□□□□□ -1.59
USB1Q12208 HOS1YPR068C 1413 nt5.11□□□□□ -1.59
USB1Q12208 PRI2YKL045W 1587 nt5.11□□□□□ -1.59
USB1Q12208 RMD9YGL107C 1941 nt5.11□□□□□ -1.59
USB1Q12208 CCZ1YBR131W 2115 nt5.11□□□□□ -1.59
USB1Q12208 LYS21YDL131W 1323 nt5.1□□□□□ -1.59
USB1Q12208 YDR396WYDR396W 501 nt5.1□□□□□ -1.59
USB1Q12208 RPN11YFR004W 921 nt5.1□□□□□ -1.59
USB1Q12208 NCS6YGL211W 1080 nt5.1□□□□□ -1.59
USB1Q12208 ATG7YHR171W 1893 nt5.1□□□□□ -1.59
USB1Q12208 DOT5YIL010W 648 nt5.1□□□□□ -1.59
USB1Q12208 HSP150YJL159W 1242 nt5.1□□□□□ -1.59
USB1Q12208 YMR155WYMR155W 1644 nt5.1□□□□□ -1.59
USB1Q12208 RGD1YBR260C 2001 nt5.1□□□□□ -1.59
USB1Q12208 MCM3YEL032W 2916 nt5.1□□□□□ -1.59
USB1Q12208 PYK2YOR347C 1521 nt5.09□□□□□ -1.59
USB1Q12208 YER186CYER186C 921 nt5.09□□□□□ -1.59
USB1Q12208 MED6YHR058C 888 nt5.09□□□□□ -1.59
USB1Q12208 EFM3YJR129C 1020 nt5.09□□□□□ -1.59
USB1Q12208 YJU3YKL094W 942 nt5.09□□□□□ -1.59
USB1Q12208 COX17YLL009C 210 nt5.09□□□□□ -1.59
USB1Q12208 RAD3YER171W 2337 nt5.08□□□□□ -1.6
USB1Q12208 OAC1YKL120W 975 nt5.08□□□□□ -1.6
USB1Q12208 MRPS5YBR251W 924 nt5.08□□□□□ -1.6
USB1Q12208 YPK2YMR104C 2034 nt5.07□□□□□ -1.6
USB1Q12208 RHO4YKR055W 876 nt5.07□□□□□ -1.6
USB1Q12208 RPL10YLR075W 666 nt5.07□□□□□ -1.6
USB1Q12208 AVO2YMR068W 1281 nt5.07□□□□□ -1.6
USB1Q12208 GAT1YFL021W 1533 nt5.07□□□□□ -1.6
USB1Q12208 YGR176WYGR176W 348 nt5.06□□□□□ -1.6
USB1Q12208 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.06□□□□□ -1.6
USB1Q12208 VMA4YOR332W 702 nt5.06□□□□□ -1.6
USB1Q12208 HSP78YDR258C 2436 nt5.06□□□□□ -1.6
USB1Q12208 VPS1YKR001C 2115 nt5.05□□□□□ -1.6
USB1Q12208 ADE12YNL220W 1302 nt5.05□□□□□ -1.6
USB1Q12208 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.05□□□□□ -1.6
USB1Q12208 VAM7YGL212W 951 nt5.05□□□□□ -1.6
USB1Q12208 DJP1YIR004W 1299 nt5.05□□□□□ -1.6
USB1Q12208 PDB1YBR221C 1101 nt5.05□□□□□ -1.6
USB1Q12208 VPS5YOR069W 2028 nt5.05□□□□□ -1.6
USB1Q12208 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.04□□□□□ -1.6
USB1Q12208 RPL7AYGL076C 735 nt5.04□□□□□ -1.6
USB1Q12208 RPS2YGL123W 765 nt5.04□□□□□ -1.6
USB1Q12208 RHO3YIL118W 696 nt5.04□□□□□ -1.6
USB1Q12208 APN1YKL114C 1104 nt5.04□□□□□ -1.6
USB1Q12208 RPL7BYPL198W 735 nt5.04□□□□□ -1.6
USB1Q12208 ENV7YPL236C 1095 nt5.04□□□□□ -1.6
USB1Q12208 BNA5YLR231C 1362 nt5.04□□□□□ -1.6
USB1Q12208 RME1YGR044C 903 nt5.03□□□□□ -1.6
USB1Q12208 PHB1YGR132C 864 nt5.03□□□□□ -1.6
USB1Q12208 LYS12YIL094C 1116 nt5.03□□□□□ -1.6
USB1Q12208 PYC1YGL062W 3537 nt5.03□□□□□ -1.6
USB1Q12208 ECM3YOR092W 1842 nt5.02□□□□□ -1.61
USB1Q12208 NPA3YJR072C 1158 nt5.02□□□□□ -1.61
USB1Q12208 SEN34YAR008W 828 nt5.02□□□□□ -1.61
USB1Q12208 TAL1YLR354C 1008 nt5.02□□□□□ -1.61
USB1Q12208 SEC17YBL050W 879 nt5.02□□□□□ -1.61
USB1Q12208 UBC11YOR339C 471 nt5.02□□□□□ -1.61
USB1Q12208 SUE1YPR151C 621 nt5.02□□□□□ -1.61
USB1Q12208 DIA3YDL024C 1407 nt5.02□□□□□ -1.61
USB1Q12208 GIT1YCR098C 1557 nt5.02□□□□□ -1.61
USB1Q12208 VRP1YLR337C 2454 nt5.02□□□□□ -1.61
USB1Q12208 VAN1YML115C 1608 nt5.01□□□□□ -1.61
USB1Q12208 RBA50YDR527W 1320 nt5.01□□□□□ -1.61
USB1Q12208 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.01□□□□□ -1.61
USB1Q12208 KSS1YGR040W 1107 nt5.01□□□□□ -1.61
USB1Q12208 UIP4YPL186C 915 nt5.01□□□□□ -1.61
USB1Q12208 ERC1YHR032W 1746 nt5□□□□□ -1.61
USB1Q12208 SIT4YDL047W 936 nt5□□□□□ -1.61
USB1Q12208 TIF2YJL138C 1188 nt5□□□□□ -1.61
USB1Q12208 TIF1YKR059W 1188 nt5□□□□□ -1.61
USB1Q12208 NHP6BYBR089C-A 300 nt5□□□□□ -1.61
USB1Q12208 YBR144CYBR144C 315 nt5□□□□□ -1.61
USB1Q12208 VPS72YDR485C 2388 nt5□□□□□ -1.61
USB1Q12208 VNX1YNL321W 2727 nt4.99□□□□□ -1.61
USB1Q12208 YME1YPR024W 2244 nt4.99□□□□□ -1.61
USB1Q12208 APE3YBR286W 1614 nt4.99□□□□□ -1.61
USB1Q12208 ARP1YHR129C 1155 nt4.99□□□□□ -1.61
USB1Q12208 STM1YLR150W 822 nt4.99□□□□□ -1.61
USB1Q12208 SCO2YBR024W 906 nt4.99□□□□□ -1.61
USB1Q12208 NME1NME1 340 nt4.99□□□□□ -1.61
USB1Q12208 HSP104YLL026W 2727 nt4.99□□□□□ -1.61
USB1Q12208 CLB2YPR119W 1476 nt4.99□□□□□ -1.61
USB1Q12208 YDR109CYDR109C 2148 nt4.99□□□□□ -1.61
USB1Q12208 ESC8YOL017W 2145 nt4.99□□□□□ -1.61
USB1Q12208 STB5YHR178W 2232 nt4.99□□□□□ -1.61
USB1Q12208 CST6YIL036W 1764 nt4.99□□□□□ -1.61
USB1Q12208 IDP1YDL066W 1287 nt4.98□□□□□ -1.61
USB1Q12208 AAD15YOL165C 432 nt4.98□□□□□ -1.61
USB1Q12208 ENV9YOR246C 993 nt4.98□□□□□ -1.61
USB1Q12208 GLE1YDL207W 1617 nt4.97□□□□□ -1.61
USB1Q12208 MID1YNL291C 1647 nt4.97□□□□□ -1.61
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