Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 CHL4YDR254W 1377 nt6.1□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 RPN11YFR004W 921 nt6.1□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 DJP1YIR004W 1299 nt6.1□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 ARA2YMR041C 1008 nt6.1□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt6.1□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 SRP101YDR292C 1866 nt6.1□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 MNN5YJL186W 1761 nt6.1□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 TRP5YGL026C 2124 nt6.1□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 YDR514CYDR514C 1452 nt6.09□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 PRP24YMR268C 1335 nt6.09□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 IRC7YFR055W 1023 nt6.09□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 ICT1YLR099C 1185 nt6.09□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 YBR144CYBR144C 315 nt6.09□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 IFA38YBR159W 1044 nt6.09□□□□□ -1.43
VPS54Q12071 SYF2YGR129W 648 nt6.08□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 SUP2tY(GUA)D 75 nt6.08□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 SUP11tY(GUA)F1 75 nt6.08□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 SUP6tY(GUA)F2 75 nt6.08□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 SUP7tY(GUA)J1 75 nt6.08□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 SUP4tY(GUA)J2 75 nt6.08□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 SUP5tY(GUA)M1 75 nt6.08□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 SUP8tY(GUA)M2 75 nt6.08□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 SUP3tY(GUA)O 75 nt6.08□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.08□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 YNR040WYNR040W 771 nt6.08□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 YMR027WYMR027W 1413 nt6.08□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 RAD3YER171W 2337 nt6.07□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 YJU3YKL094W 942 nt6.07□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 YPR123CYPR123C 435 nt6.07□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 BZZ1YHR114W 1902 nt6.07□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 PUF3YLL013C 2640 nt6.07□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 PCS60YBR222C 1632 nt6.07□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 DRS1YLL008W 2259 nt6.06□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 RRP4YHR069C 1080 nt6.06□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 YHR145CYHR145C 357 nt6.06□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 SNO4YMR322C 714 nt6.06□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 HSP33YOR391C 714 nt6.06□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 RPS9AYPL081W 594 nt6.06□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 HSP32YPL280W 714 nt6.06□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 PZF1YPR186C 1290 nt6.06□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 DUG1YFR044C 1446 nt6.06□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 LDB19YOR322C 2457 nt6.05□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 MTC5YDR128W 3447 nt6.04□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 SAC6YDR129C 1929 nt6.04□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 YDL114WYDL114W 927 nt6.04□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 SOH1YGL127C 384 nt6.04□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 SWP1YMR149W 861 nt6.04□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 CSL4YNL232W 879 nt6.04□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 RPO26YPR187W 468 nt6.04□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 MTF2YDL044C 1323 nt6.03□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 VRP1YLR337C 2454 nt6.03□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 YDL172CYDL172C 480 nt6.03□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 HAP2YGL237C 798 nt6.03□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 MRS1YIR021W 1092 nt6.03□□□□□ -1.44
VPS54Q12071 STB5YHR178W 2232 nt6.02□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 AI5_BETAQ0075 1065 nt6.02□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 SEC20YDR498C 1152 nt6.02□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 YGL072CYGL072C 360 nt6.02□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 RPE1YJL121C 717 nt6.02□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 HSP150YJL159W 1242 nt6.02□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 SSP120YLR250W 705 nt6.02□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 XBP1YIL101C 1944 nt6.01□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 MDH3YDL078C 1032 nt6.01□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 RME1YGR044C 903 nt6.01□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 ERP5YHR110W 639 nt6.01□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 APS3YJL024C 585 nt6.01□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 AMD1YML035C 2433 nt6.01□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 PDR18YNR070W 4002 nt6.01□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 DDC1YPL194W 1839 nt6.01□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 DIA3YDL024C 1407 nt6□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 GLE1YDL207W 1617 nt6□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt6□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 ATO3YDR384C 828 nt6□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 NCS6YGL211W 1080 nt6□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 QNS1YHR074W 2145 nt6□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 LYS12YIL094C 1116 nt6□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 NPA3YJR072C 1158 nt6□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 SLD7YOR060C 774 nt6□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 ATG23YLR431C 1362 nt6□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 VMS1YDR049W 1899 nt6□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 YML082WYML082W 1950 nt6□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 GAT1YFL021W 1533 nt5.99□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 YPK2YMR104C 2034 nt5.99□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 ATG7YHR171W 1893 nt5.99□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 VMA4YOR332W 702 nt5.99□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 ERC1YHR032W 1746 nt5.99□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 SEC18YBR080C 2277 nt5.99□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 IES1YFL013C 2079 nt5.98□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 MRC1YCL061C 3291 nt5.98□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 LSG1YGL099W 1923 nt5.98□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 PAT1YCR077C 2391 nt5.98□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 YDL119CYDL119C 924 nt5.98□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 RPS2YGL123W 765 nt5.98□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 SIT1YEL065W 1887 nt5.98□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 YRA1YDR381W 681 nt5.97□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 YIL077CYIL077C 963 nt5.97□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 TAL1YLR354C 1008 nt5.97□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 MRPL22YNL177C 930 nt5.97□□□□□ -1.45
VPS54Q12071 YEL020CYEL020C 1683 nt5.97□□□□□ -1.45
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