Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CPSF1Q10570 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.64■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CPSF1Q10570 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.81
CPSF1Q10570 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.8
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