Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD86

INCA1, Protein INCA1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCA1Q0VD86 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INCA1Q0VD86 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INCA1Q0VD86 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
INCA1Q0VD86 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INCA1Q0VD86 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INCA1Q0VD86 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INCA1Q0VD86 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INCA1Q0VD86 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INCA1Q0VD86 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INCA1Q0VD86 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
INCA1Q0VD86 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
INCA1Q0VD86 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
INCA1Q0VD86 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
INCA1Q0VD86 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
INCA1Q0VD86 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
INCA1Q0VD86 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INCA1Q0VD86 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
INCA1Q0VD86 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
INCA1Q0VD86 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
INCA1Q0VD86 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
INCA1Q0VD86 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
INCA1Q0VD86 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
INCA1Q0VD86 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INCA1Q0VD86 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INCA1Q0VD86 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INCA1Q0VD86 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
INCA1Q0VD86 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INCA1Q0VD86 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
INCA1Q0VD86 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms