Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SYCNQ0VAF6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SYCNQ0VAF6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms