Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NCBP1Q09161 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NCBP1Q09161 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NCBP1Q09161 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NCBP1Q09161 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms