Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD300CQ08708 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD300CQ08708 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CD300CQ08708 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms