Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDE4CQ08493 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE4CQ08493 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE4CQ08493 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms