Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 IFA38YBR159W 1044 nt6.93□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 HSM3YBR272C 1443 nt6.93□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 BSC5YNR069C 1470 nt6.92□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 YEL068CYEL068C 333 nt6.92□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 LDS1YAL018C 978 nt6.92□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 ARC19YKL013C 516 nt6.92□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 RPS28AYOR167C 204 nt6.92□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 CTF18YMR078C 2226 nt6.92□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 YDL157CYDL157C 357 nt6.91□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 MPS2YGL075C 1164 nt6.91□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 MSP1YGR028W 1089 nt6.91□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 MDH1YKL085W 1005 nt6.91□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 YMR122CYMR122C 375 nt6.91□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 PEX34YCL056C 435 nt6.91□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 ATG4YNL223W 1485 nt6.91□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 FRE5YOR384W 2085 nt6.91□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 RMD9YGL107C 1941 nt6.9□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 IES1YFL013C 2079 nt6.9□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 YHL018WYHL018W 363 nt6.9□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 MHO1YJR008W 1017 nt6.9□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 TDH2YJR009C 999 nt6.9□□□□□ -1.3
HRQ1Q05549 RAD3YER171W 2337 nt6.89□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 YDL129WYDL129W 876 nt6.89□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6.89□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 GTO1YGR154C 1071 nt6.89□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 SUP2tY(GUA)D 75 nt6.89□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 SUP11tY(GUA)F1 75 nt6.89□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 SUP6tY(GUA)F2 75 nt6.89□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 SUP7tY(GUA)J1 75 nt6.89□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 SUP4tY(GUA)J2 75 nt6.89□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 SUP5tY(GUA)M1 75 nt6.89□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 SUP8tY(GUA)M2 75 nt6.89□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 SUP3tY(GUA)O 75 nt6.89□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 YJU3YKL094W 942 nt6.89□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 MRPS16YPL013C 366 nt6.89□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 ELC1YPL046C 300 nt6.89□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 SPO77YLR341W 1434 nt6.89□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 XBP1YIL101C 1944 nt6.89□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 MTC5YDR128W 3447 nt6.88□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 HAL5YJL165C 2568 nt6.88□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 PCL9YDL179W 915 nt6.88□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 HVG1YER039C 750 nt6.88□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 RPL7AYGL076C 735 nt6.88□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 GCV3YAL044C 513 nt6.88□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 RPL7BYPL198W 735 nt6.88□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 NHP6BYBR089C-A 300 nt6.88□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 RSA4YCR072C 1548 nt6.87□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 SPC42YKL042W 1092 nt6.87□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 SRY1YKL218C 981 nt6.87□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 RPL10YLR075W 666 nt6.87□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 NEJ1YLR265C 1029 nt6.87□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 TAL1YLR354C 1008 nt6.87□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 JNM1YMR294W 1122 nt6.87□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 DIA1YMR316W 1011 nt6.87□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 YNR040WYNR040W 771 nt6.87□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 MSS116YDR194C 1995 nt6.87□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 YBR284WYBR284W 2394 nt6.87□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 ERG1YGR175C 1491 nt6.86□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 TFC6YDR362C 2019 nt6.86□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 HAP3YBL021C 435 nt6.86□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 ACS1YAL054C 2142 nt6.86□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 ARH1YDR376W 1482 nt6.85□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 CLB2YPR119W 1476 nt6.85□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 CLB1YGR108W 1416 nt6.85□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 ICL1YER065C 1674 nt6.85□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 PMP3YDR276C 168 nt6.85□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt6.85□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 YMR295CYMR295C 594 nt6.85□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 CAF40YNL288W 1122 nt6.85□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 LAG2YOL025W 1983 nt6.85□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 GPB2YAL056W 2643 nt6.85□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 SKI2YLR398C 3864 nt6.85□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 KEX2YNL238W 2445 nt6.85□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 UTP4YDR324C 2331 nt6.84□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 OPI7YDR360W 435 nt6.84□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 GUS1YGL245W 2127 nt6.84□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 YOL024WYOL024W 519 nt6.84□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 VAM3YOR106W 852 nt6.84□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 ERC1YHR032W 1746 nt6.84□□□□□ -1.31
HRQ1Q05549 OPT1YJL212C 2400 nt6.84□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 MPC54YOR177C 1395 nt6.83□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 HIR1YBL008W 2523 nt6.83□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 YDR015CYDR015C 240 nt6.83□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 TFG2YGR005C 1203 nt6.83□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 DRE2YKR071C 1047 nt6.83□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 YNL285WYNL285W 372 nt6.83□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 DAL7YIR031C 1665 nt6.83□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 EFT2YDR385W 2529 nt6.83□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 EFT1YOR133W 2529 nt6.83□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 GUA1YMR217W 1578 nt6.82□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 RAD24YER173W 1980 nt6.82□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 YEA6YEL006W 1008 nt6.82□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 POR2YIL114C 846 nt6.82□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 SCS7YMR272C 1155 nt6.82□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 ISA2YPR067W 558 nt6.82□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 GIT1YCR098C 1557 nt6.82□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 IVY1YDR229W 1362 nt6.82□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 MST1YKL194C 1389 nt6.82□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 RRP9YPR137W 1722 nt6.81□□□□□ -1.32
HRQ1Q05549 PYC1YGL062W 3537 nt6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38 ms