Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSBP1Q04837 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SSBP1Q04837 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SSBP1Q04837 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms