Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KRT17Q04695 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT17Q04695 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT17Q04695 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms