Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC4Q03721 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNC4Q03721 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNC4Q03721 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms