Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CENPEQ02224 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CENPEQ02224 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CENPEQ02224 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CENPEQ02224 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms