Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MDM2Q00987 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MDM2Q00987 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MDM2Q00987 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
MDM2Q00987 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MDM2Q00987 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms