Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF9Q00978 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IRF9Q00978 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IRF9Q00978 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms