Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NFKB2Q00653 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NFKB2Q00653 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NFKB2Q00653 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms