Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NDPQ00604 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
NDPQ00604 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NDPQ00604 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NDPQ00604 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NDPQ00604 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDPQ00604 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDPQ00604 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDPQ00604 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDPQ00604 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDPQ00604 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDPQ00604 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDPQ00604 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
NDPQ00604 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDPQ00604 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDPQ00604 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NDPQ00604 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NDPQ00604 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NDPQ00604 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NDPQ00604 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NDPQ00604 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NDPQ00604 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
NDPQ00604 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NDPQ00604 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NDPQ00604 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NDPQ00604 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDPQ00604 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDPQ00604 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDPQ00604 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDPQ00604 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
NDPQ00604 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NDPQ00604 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDPQ00604 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NDPQ00604 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDPQ00604 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NDPQ00604 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDPQ00604 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDPQ00604 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NDPQ00604 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDPQ00604 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDPQ00604 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NDPQ00604 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDPQ00604 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDPQ00604 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDPQ00604 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDPQ00604 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDPQ00604 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDPQ00604 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDPQ00604 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDPQ00604 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NDPQ00604 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NDPQ00604 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDPQ00604 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDPQ00604 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDPQ00604 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDPQ00604 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDPQ00604 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDPQ00604 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDPQ00604 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDPQ00604 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDPQ00604 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDPQ00604 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NDPQ00604 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDPQ00604 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDPQ00604 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NDPQ00604 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDPQ00604 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDPQ00604 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDPQ00604 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDPQ00604 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDPQ00604 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDPQ00604 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDPQ00604 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NDPQ00604 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDPQ00604 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDPQ00604 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDPQ00604 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDPQ00604 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDPQ00604 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDPQ00604 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDPQ00604 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NDPQ00604 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDPQ00604 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NDPQ00604 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDPQ00604 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDPQ00604 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDPQ00604 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDPQ00604 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDPQ00604 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDPQ00604 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDPQ00604 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDPQ00604 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDPQ00604 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDPQ00604 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDPQ00604 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDPQ00604 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDPQ00604 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NDPQ00604 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NDPQ00604 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NDPQ00604 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms