Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDKL1Q00532 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CDKL1Q00532 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDKL1Q00532 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms