Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FGD1P98174 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD1P98174 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD1P98174 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD1P98174 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD1P98174 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FGD1P98174 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD1P98174 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD1P98174 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD1P98174 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD1P98174 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD1P98174 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD1P98174 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD1P98174 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FGD1P98174 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD1P98174 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD1P98174 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FGD1P98174 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FGD1P98174 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD1P98174 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD1P98174 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD1P98174 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD1P98174 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD1P98174 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD1P98174 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD1P98174 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD1P98174 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FGD1P98174 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD1P98174 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD1P98174 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD1P98174 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FGD1P98174 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGD1P98174 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGD1P98174 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGD1P98174 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGD1P98174 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FGD1P98174 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD1P98174 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD1P98174 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD1P98174 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD1P98174 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD1P98174 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD1P98174 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FGD1P98174 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD1P98174 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD1P98174 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD1P98174 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD1P98174 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD1P98174 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD1P98174 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD1P98174 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD1P98174 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FGD1P98174 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD1P98174 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FGD1P98174 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD1P98174 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD1P98174 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD1P98174 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD1P98174 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD1P98174 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FGD1P98174 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD1P98174 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD1P98174 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD1P98174 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FGD1P98174 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD1P98174 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD1P98174 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FGD1P98174 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD1P98174 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD1P98174 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD1P98174 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD1P98174 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD1P98174 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD1P98174 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD1P98174 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD1P98174 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FGD1P98174 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD1P98174 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD1P98174 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FGD1P98174 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD1P98174 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD1P98174 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD1P98174 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FGD1P98174 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGD1P98174 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGD1P98174 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGD1P98174 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGD1P98174 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGD1P98174 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGD1P98174 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FGD1P98174 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FGD1P98174 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FGD1P98174 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FGD1P98174 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FGD1P98174 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FGD1P98174 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FGD1P98174 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FGD1P98174 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FGD1P98174 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FGD1P98174 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms