Protein–RNA interactions for Protein: P78330

PSPH, Phosphoserine phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPHP78330 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPHP78330 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPHP78330 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPHP78330 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPHP78330 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPHP78330 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PSPHP78330 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPHP78330 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPHP78330 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPHP78330 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPHP78330 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPHP78330 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PSPHP78330 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPHP78330 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPHP78330 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPHP78330 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPHP78330 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPHP78330 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PSPHP78330 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSPHP78330 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PSPHP78330 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPHP78330 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPHP78330 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPHP78330 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPHP78330 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPHP78330 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPHP78330 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPHP78330 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PSPHP78330 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPHP78330 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPHP78330 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPHP78330 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPHP78330 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPHP78330 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPHP78330 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPHP78330 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPHP78330 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPHP78330 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPHP78330 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PSPHP78330 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPHP78330 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPHP78330 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPHP78330 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPHP78330 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PSPHP78330 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPHP78330 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPHP78330 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPHP78330 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPHP78330 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PSPHP78330 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPHP78330 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPHP78330 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPHP78330 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPHP78330 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPHP78330 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPHP78330 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPHP78330 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPHP78330 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPHP78330 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPHP78330 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPHP78330 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PSPHP78330 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPHP78330 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPHP78330 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPHP78330 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPHP78330 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPHP78330 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPHP78330 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPHP78330 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PSPHP78330 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPHP78330 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPHP78330 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPHP78330 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPHP78330 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPHP78330 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPHP78330 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPHP78330 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPHP78330 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPHP78330 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PSPHP78330 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSPHP78330 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PSPHP78330 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSPHP78330 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PSPHP78330 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSPHP78330 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSPHP78330 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PSPHP78330 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPHP78330 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPHP78330 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPHP78330 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPHP78330 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPHP78330 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPHP78330 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPHP78330 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPHP78330 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPHP78330 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPHP78330 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PSPHP78330 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPHP78330 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PSPHP78330 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms