Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23P62829 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPL23P62829 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23P62829 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23P62829 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23P62829 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23P62829 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23P62829 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23P62829 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23P62829 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23P62829 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23P62829 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPL23P62829 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23P62829 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23P62829 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23P62829 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23P62829 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23P62829 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23P62829 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23P62829 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23P62829 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPL23P62829 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23P62829 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23P62829 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23P62829 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23P62829 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23P62829 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23P62829 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RPL23P62829 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RPL23P62829 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23P62829 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23P62829 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23P62829 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23P62829 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23P62829 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23P62829 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23P62829 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23P62829 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RPL23P62829 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23P62829 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23P62829 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23P62829 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23P62829 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23P62829 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23P62829 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23P62829 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23P62829 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23P62829 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23P62829 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23P62829 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23P62829 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RPL23P62829 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23P62829 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23P62829 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23P62829 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23P62829 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23P62829 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23P62829 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23P62829 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23P62829 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23P62829 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23P62829 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23P62829 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23P62829 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RPL23P62829 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23P62829 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23P62829 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23P62829 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RPL23P62829 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23P62829 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23P62829 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23P62829 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23P62829 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23P62829 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23P62829 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23P62829 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23P62829 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23P62829 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23P62829 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23P62829 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23P62829 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPL23P62829 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23P62829 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23P62829 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23P62829 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23P62829 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23P62829 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23P62829 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23P62829 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23P62829 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23P62829 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23P62829 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23P62829 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23P62829 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23P62829 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23P62829 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23P62829 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPL23P62829 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPL23P62829 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPL23P62829 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms