Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SNRPD3P62318 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNRPD3P62318 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNRPD3P62318 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms