Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SNRPFP62306 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SNRPFP62306 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SNRPFP62306 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms