Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EEFSECP57772 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEFSECP57772 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEFSECP57772 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms