Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GSDMDP57764 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GSDMDP57764 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GSDMDP57764 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms