Protein–RNA interactions for Protein: P56557

TMEM50B, Transmembrane protein 50B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM50BP56557 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TMEM50BP56557 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMEM50BP56557 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM50BP56557 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM50BP56557 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMEM50BP56557 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMEM50BP56557 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms