Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRKAG1P54619 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRKAG1P54619 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAG1P54619 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms