Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ITGA8P53708 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ITGA8P53708 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms