Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARFIP1P53367 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARFIP1P53367 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms