Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARFIP2P53365 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFIP2P53365 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFIP2P53365 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFIP2P53365 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms