Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK2P51955 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEK2P51955 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK2P51955 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK2P51955 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK2P51955 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK2P51955 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK2P51955 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK2P51955 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK2P51955 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEK2P51955 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK2P51955 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK2P51955 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK2P51955 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK2P51955 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK2P51955 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK2P51955 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK2P51955 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK2P51955 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK2P51955 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK2P51955 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK2P51955 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK2P51955 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEK2P51955 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK2P51955 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK2P51955 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK2P51955 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK2P51955 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK2P51955 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEK2P51955 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK2P51955 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK2P51955 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK2P51955 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK2P51955 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK2P51955 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK2P51955 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK2P51955 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK2P51955 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK2P51955 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK2P51955 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK2P51955 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK2P51955 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEK2P51955 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK2P51955 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK2P51955 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK2P51955 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK2P51955 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK2P51955 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK2P51955 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEK2P51955 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK2P51955 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK2P51955 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK2P51955 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK2P51955 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK2P51955 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK2P51955 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK2P51955 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK2P51955 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK2P51955 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK2P51955 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK2P51955 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK2P51955 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEK2P51955 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK2P51955 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK2P51955 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK2P51955 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK2P51955 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEK2P51955 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK2P51955 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK2P51955 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK2P51955 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEK2P51955 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEK2P51955 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEK2P51955 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEK2P51955 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEK2P51955 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEK2P51955 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEK2P51955 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK2P51955 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK2P51955 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK2P51955 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK2P51955 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK2P51955 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK2P51955 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK2P51955 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK2P51955 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK2P51955 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEK2P51955 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK2P51955 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK2P51955 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK2P51955 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK2P51955 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK2P51955 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK2P51955 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK2P51955 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK2P51955 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NEK2P51955 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK2P51955 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK2P51955 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NEK2P51955 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms