Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNHP51946 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNHP51946 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNHP51946 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNHP51946 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNHP51946 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNHP51946 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNHP51946 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNHP51946 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNHP51946 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNHP51946 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNHP51946 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCNHP51946 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNHP51946 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNHP51946 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNHP51946 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNHP51946 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNHP51946 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNHP51946 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNHP51946 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNHP51946 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNHP51946 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNHP51946 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNHP51946 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNHP51946 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNHP51946 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNHP51946 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNHP51946 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNHP51946 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNHP51946 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNHP51946 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNHP51946 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNHP51946 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNHP51946 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNHP51946 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNHP51946 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNHP51946 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNHP51946 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNHP51946 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNHP51946 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNHP51946 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNHP51946 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNHP51946 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNHP51946 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNHP51946 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNHP51946 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNHP51946 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNHP51946 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNHP51946 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNHP51946 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNHP51946 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNHP51946 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNHP51946 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNHP51946 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNHP51946 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNHP51946 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNHP51946 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNHP51946 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNHP51946 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNHP51946 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNHP51946 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNHP51946 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNHP51946 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNHP51946 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNHP51946 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNHP51946 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNHP51946 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNHP51946 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNHP51946 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNHP51946 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNHP51946 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNHP51946 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNHP51946 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNHP51946 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNHP51946 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNHP51946 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNHP51946 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNHP51946 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNHP51946 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNHP51946 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNHP51946 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNHP51946 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNHP51946 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNHP51946 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNHP51946 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNHP51946 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNHP51946 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNHP51946 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNHP51946 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNHP51946 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNHP51946 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNHP51946 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNHP51946 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNHP51946 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCNHP51946 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNHP51946 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNHP51946 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNHP51946 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNHP51946 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCNHP51946 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms