Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLCNKBP51801 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CLCNKBP51801 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCNKBP51801 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms