Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8P50990 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8P50990 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8P50990 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCT8P50990 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8P50990 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8P50990 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8P50990 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8P50990 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8P50990 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8P50990 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8P50990 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8P50990 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8P50990 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCT8P50990 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT8P50990 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT8P50990 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT8P50990 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT8P50990 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT8P50990 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT8P50990 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT8P50990 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCT8P50990 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8P50990 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8P50990 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8P50990 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8P50990 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8P50990 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8P50990 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8P50990 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8P50990 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8P50990 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8P50990 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8P50990 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8P50990 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8P50990 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8P50990 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8P50990 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8P50990 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8P50990 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8P50990 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8P50990 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8P50990 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8P50990 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8P50990 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8P50990 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8P50990 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8P50990 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8P50990 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8P50990 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8P50990 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8P50990 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8P50990 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8P50990 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8P50990 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8P50990 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8P50990 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8P50990 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8P50990 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8P50990 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8P50990 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8P50990 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8P50990 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8P50990 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8P50990 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8P50990 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8P50990 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8P50990 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8P50990 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8P50990 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8P50990 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8P50990 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8P50990 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8P50990 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT8P50990 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT8P50990 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT8P50990 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT8P50990 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT8P50990 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT8P50990 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT8P50990 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT8P50990 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT8P50990 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT8P50990 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT8P50990 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT8P50990 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT8P50990 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT8P50990 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT8P50990 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT8P50990 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT8P50990 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT8P50990 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT8P50990 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT8P50990 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8P50990 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8P50990 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8P50990 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8P50990 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8P50990 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8P50990 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms