Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCAMP50895 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCAMP50895 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCAMP50895 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BCAMP50895 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCAMP50895 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCAMP50895 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCAMP50895 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BCAMP50895 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCAMP50895 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCAMP50895 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BCAMP50895 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCAMP50895 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCAMP50895 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCAMP50895 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCAMP50895 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BCAMP50895 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCAMP50895 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCAMP50895 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCAMP50895 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCAMP50895 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCAMP50895 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCAMP50895 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCAMP50895 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCAMP50895 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
BCAMP50895 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCAMP50895 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCAMP50895 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCAMP50895 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCAMP50895 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCAMP50895 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCAMP50895 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BCAMP50895 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
BCAMP50895 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BCAMP50895 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BCAMP50895 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCAMP50895 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCAMP50895 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCAMP50895 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCAMP50895 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCAMP50895 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCAMP50895 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BCAMP50895 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BCAMP50895 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BCAMP50895 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BCAMP50895 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
BCAMP50895 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BCAMP50895 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BCAMP50895 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCAMP50895 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCAMP50895 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCAMP50895 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
BCAMP50895 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCAMP50895 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCAMP50895 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCAMP50895 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BCAMP50895 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCAMP50895 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCAMP50895 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCAMP50895 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCAMP50895 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCAMP50895 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BCAMP50895 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BCAMP50895 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BCAMP50895 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BCAMP50895 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCAMP50895 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCAMP50895 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCAMP50895 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCAMP50895 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
BCAMP50895 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BCAMP50895 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
BCAMP50895 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BCAMP50895 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BCAMP50895 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCAMP50895 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCAMP50895 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCAMP50895 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCAMP50895 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCAMP50895 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCAMP50895 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BCAMP50895 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCAMP50895 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCAMP50895 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCAMP50895 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCAMP50895 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCAMP50895 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BCAMP50895 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCAMP50895 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCAMP50895 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCAMP50895 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCAMP50895 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BCAMP50895 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCAMP50895 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BCAMP50895 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCAMP50895 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCAMP50895 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BCAMP50895 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCAMP50895 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BCAMP50895 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms