Protein–RNA interactions for Protein: P50750

CDK9, Cyclin-dependent kinase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK9P50750 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK9P50750 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK9P50750 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK9P50750 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK9P50750 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK9P50750 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK9P50750 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK9P50750 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDK9P50750 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK9P50750 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK9P50750 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK9P50750 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK9P50750 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK9P50750 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK9P50750 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK9P50750 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK9P50750 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK9P50750 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDK9P50750 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDK9P50750 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK9P50750 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK9P50750 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDK9P50750 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK9P50750 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK9P50750 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK9P50750 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK9P50750 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK9P50750 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK9P50750 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK9P50750 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK9P50750 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK9P50750 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK9P50750 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK9P50750 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK9P50750 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK9P50750 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK9P50750 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK9P50750 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK9P50750 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK9P50750 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK9P50750 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK9P50750 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK9P50750 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK9P50750 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK9P50750 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK9P50750 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK9P50750 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK9P50750 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK9P50750 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK9P50750 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK9P50750 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK9P50750 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK9P50750 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK9P50750 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK9P50750 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK9P50750 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK9P50750 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK9P50750 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK9P50750 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK9P50750 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK9P50750 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK9P50750 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK9P50750 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK9P50750 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK9P50750 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK9P50750 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK9P50750 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK9P50750 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK9P50750 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK9P50750 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK9P50750 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDK9P50750 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK9P50750 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK9P50750 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK9P50750 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK9P50750 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK9P50750 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK9P50750 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK9P50750 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK9P50750 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDK9P50750 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK9P50750 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK9P50750 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK9P50750 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK9P50750 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK9P50750 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDK9P50750 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK9P50750 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK9P50750 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK9P50750 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK9P50750 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDK9P50750 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK9P50750 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK9P50750 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK9P50750 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK9P50750 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDK9P50750 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDK9P50750 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK9P50750 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDK9P50750 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms