Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KNTC1P50748 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KNTC1P50748 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KNTC1P50748 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KNTC1P50748 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms