Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CRIP1P50238 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CRIP1P50238 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms