Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK1EP49674 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CSNK1EP49674 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSNK1EP49674 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms