Protein–RNA interactions for Protein: P49643

PRIM2, DNA primase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM2P49643 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRIM2P49643 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRIM2P49643 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRIM2P49643 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms