Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC34P49427 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC34P49427 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC34P49427 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC34P49427 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC34P49427 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC34P49427 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC34P49427 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC34P49427 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC34P49427 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC34P49427 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDC34P49427 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC34P49427 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC34P49427 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC34P49427 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC34P49427 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC34P49427 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDC34P49427 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC34P49427 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC34P49427 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC34P49427 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC34P49427 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC34P49427 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC34P49427 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC34P49427 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC34P49427 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDC34P49427 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC34P49427 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC34P49427 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC34P49427 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC34P49427 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDC34P49427 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC34P49427 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC34P49427 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC34P49427 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC34P49427 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC34P49427 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC34P49427 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC34P49427 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDC34P49427 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC34P49427 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC34P49427 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC34P49427 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC34P49427 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC34P49427 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC34P49427 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC34P49427 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC34P49427 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC34P49427 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC34P49427 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC34P49427 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC34P49427 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC34P49427 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC34P49427 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC34P49427 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC34P49427 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC34P49427 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC34P49427 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC34P49427 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC34P49427 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC34P49427 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC34P49427 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC34P49427 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC34P49427 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC34P49427 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC34P49427 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC34P49427 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC34P49427 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC34P49427 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC34P49427 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC34P49427 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC34P49427 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC34P49427 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC34P49427 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC34P49427 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC34P49427 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC34P49427 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC34P49427 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC34P49427 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC34P49427 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC34P49427 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC34P49427 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDC34P49427 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC34P49427 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC34P49427 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC34P49427 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC34P49427 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC34P49427 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC34P49427 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC34P49427 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC34P49427 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC34P49427 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDC34P49427 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC34P49427 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC34P49427 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC34P49427 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC34P49427 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC34P49427 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC34P49427 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CDC34P49427 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms