Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT3P49368 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT3P49368 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT3P49368 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT3P49368 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT3P49368 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT3P49368 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCT3P49368 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT3P49368 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT3P49368 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT3P49368 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT3P49368 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT3P49368 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT3P49368 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT3P49368 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCT3P49368 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT3P49368 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT3P49368 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT3P49368 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT3P49368 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT3P49368 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT3P49368 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCT3P49368 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT3P49368 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT3P49368 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT3P49368 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT3P49368 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT3P49368 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT3P49368 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT3P49368 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT3P49368 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCT3P49368 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT3P49368 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT3P49368 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT3P49368 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT3P49368 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT3P49368 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT3P49368 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCT3P49368 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCT3P49368 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT3P49368 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT3P49368 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT3P49368 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT3P49368 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT3P49368 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCT3P49368 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT3P49368 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT3P49368 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT3P49368 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT3P49368 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT3P49368 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT3P49368 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCT3P49368 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT3P49368 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT3P49368 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT3P49368 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT3P49368 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT3P49368 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT3P49368 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT3P49368 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCT3P49368 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT3P49368 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT3P49368 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT3P49368 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT3P49368 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT3P49368 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT3P49368 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT3P49368 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT3P49368 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT3P49368 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCT3P49368 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT3P49368 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT3P49368 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT3P49368 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT3P49368 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT3P49368 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT3P49368 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT3P49368 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT3P49368 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT3P49368 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCT3P49368 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT3P49368 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT3P49368 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT3P49368 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT3P49368 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT3P49368 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT3P49368 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT3P49368 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCT3P49368 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT3P49368 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT3P49368 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT3P49368 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT3P49368 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT3P49368 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT3P49368 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT3P49368 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT3P49368 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT3P49368 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCT3P49368 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCT3P49368 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms