Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ME1P48163 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ME1P48163 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ME1P48163 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ME1P48163 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ME1P48163 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ME1P48163 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ME1P48163 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ME1P48163 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ME1P48163 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ME1P48163 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ME1P48163 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ME1P48163 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ME1P48163 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ME1P48163 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ME1P48163 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ME1P48163 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ME1P48163 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ME1P48163 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ME1P48163 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ME1P48163 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ME1P48163 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ME1P48163 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME1P48163 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME1P48163 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME1P48163 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME1P48163 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME1P48163 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME1P48163 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME1P48163 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME1P48163 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME1P48163 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME1P48163 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME1P48163 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ME1P48163 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ME1P48163 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ME1P48163 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ME1P48163 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ME1P48163 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ME1P48163 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ME1P48163 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ME1P48163 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ME1P48163 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ME1P48163 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ME1P48163 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ME1P48163 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ME1P48163 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ME1P48163 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ME1P48163 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ME1P48163 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ME1P48163 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ME1P48163 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
ME1P48163 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ME1P48163 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ME1P48163 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ME1P48163 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ME1P48163 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ME1P48163 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ME1P48163 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ME1P48163 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ME1P48163 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ME1P48163 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ME1P48163 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ME1P48163 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ME1P48163 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ME1P48163 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ME1P48163 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ME1P48163 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ME1P48163 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ME1P48163 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ME1P48163 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ME1P48163 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ME1P48163 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ME1P48163 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ME1P48163 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ME1P48163 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ME1P48163 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ME1P48163 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ME1P48163 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ME1P48163 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ME1P48163 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ME1P48163 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ME1P48163 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ME1P48163 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ME1P48163 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ME1P48163 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ME1P48163 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME1P48163 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME1P48163 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME1P48163 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME1P48163 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME1P48163 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME1P48163 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME1P48163 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME1P48163 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME1P48163 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME1P48163 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ME1P48163 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ME1P48163 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ME1P48163 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms