Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP5P45974 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP5P45974 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP5P45974 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP5P45974 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP5P45974 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP5P45974 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP5P45974 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP5P45974 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP5P45974 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP5P45974 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
USP5P45974 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
USP5P45974 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP5P45974 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP5P45974 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP5P45974 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP5P45974 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP5P45974 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP5P45974 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP5P45974 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP5P45974 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP5P45974 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP5P45974 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP5P45974 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP5P45974 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP5P45974 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP5P45974 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP5P45974 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP5P45974 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP5P45974 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP5P45974 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP5P45974 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
USP5P45974 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
USP5P45974 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP5P45974 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP5P45974 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP5P45974 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP5P45974 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP5P45974 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP5P45974 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP5P45974 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP5P45974 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP5P45974 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP5P45974 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP5P45974 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP5P45974 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
USP5P45974 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP5P45974 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
USP5P45974 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP5P45974 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP5P45974 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USP5P45974 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP5P45974 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP5P45974 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP5P45974 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP5P45974 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP5P45974 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP5P45974 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP5P45974 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
USP5P45974 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP5P45974 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP5P45974 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USP5P45974 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP5P45974 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP5P45974 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USP5P45974 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP5P45974 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP5P45974 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP5P45974 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USP5P45974 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP5P45974 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP5P45974 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USP5P45974 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USP5P45974 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP5P45974 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP5P45974 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
USP5P45974 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP5P45974 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP5P45974 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP5P45974 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
USP5P45974 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP5P45974 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USP5P45974 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP5P45974 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP5P45974 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP5P45974 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USP5P45974 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP5P45974 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP5P45974 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP5P45974 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP5P45974 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP5P45974 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP5P45974 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP5P45974 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP5P45974 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
USP5P45974 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USP5P45974 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP5P45974 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USP5P45974 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USP5P45974 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms