Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACADSBP45954 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ACADSBP45954 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms