Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHRNA4P43681 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHRNA4P43681 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHRNA4P43681 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms